علم الجينوم البنيوي

علم الجينوم البنيوي Structural genomics، هو علم يبحث في وصف البنية ثلاثية الأبعاد لأي بروتين عن طريق الجينوم.

. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .

الأهداف

الأساليب

de novo methods

Modelling-based methods

ab initio modeling

Sequence-based modeling

Threading

أمثلة على علم الجينوم البنيوي

The Thermotogo maritima proteome

The Mycobacterium tuberculosis proteome

قواعد بيانات وتصنيفات بنية البروتين

انظر أيضا

المصادر

  • Hooft RW, Vriend G, Sander C, Abola EE (1996). "Errors in protein structures". Nature. 381 (6580): 272. doi:10.1038/381272a0. PMID 8692262. {{cite journal}}: Unknown parameter |month= ignored (help)CS1 maint: multiple names: authors list (link)
  • Marsden RL, Lewis TA, Orengo CA (2007). "Towards a comprehensive structural coverage of completed genomes: a structural genomics viewpoint". BMC Bioinformatics. 8: 86. doi:10.1186/1471-2105-8-86. PMC 1829165. PMID 17349043.{{cite journal}}: CS1 maint: multiple names: authors list (link) CS1 maint: unflagged free DOI (link)
  • Baker EN, Arcus AL, Lott JS. 2003. Protein structure prediction and analysis as a tool for functional genomics. ‘’Applied Bioinformatics’’ 2(3 Suppl):S3-S10.
  • Goulding CW ‘’et al’’. 2003. Structural genoimcs of ‘’Mycobacterium tuberculosis’’: a preliminary report of progress at UCLA. ‘’Biophysical Chemistry’’ 105: 361-370.
  • Lesley SA ‘’et al’’. 2002. Structural genomics of the ‘’Thermotoga maritima’’ proteome implemented in a high-throughput structure determination pipeline. ‘’PNAS’’ 99(18):11664-11669.
  • Skolnick J, Fetrow JS, and Kolinski A. 2000. Structural genomics and its importance for gene function analysis. ‘’Nature Biotechnology’’ 18:283-287.

وصلات خارجية